高考篮球专业班
北京君谊篮球特长课，以培养中学生专业篮球运动员为主要教学任务。历年向专业篮球队输送篮球人才。并通过体育特长生，向各个高校输送专业体育人才。

高考美术专业班
8年美术高考经验，突破性教学方法，清华美院、鲁迅美术学院专业教师授课，稳过高考美术加试。

高一普通班
君谊中学高中面向北京市招生，建立教委认可的学籍；教师都有本科以上文凭和教师资格证书，采用人教版教材及与之配套的练习册。高中设有本科班、美术班、综合班，学生升入包括重点大学在内的各类大学。2021年初中毕业学生100%升入高中，53%的学生升入重点高中；高中毕业生升学率保持在95%以上（含国内外各类高等院校），51%的学生升入重点大学。

君谊中学“新初中”
2020年，君谊中学再度完善学校育人定位，开启“新君谊初中项目”元年。特聘请创建陈经纶中学分校的刘永芬女士出任初中部校长，引领“君谊中学新初中”素质教育启动跳跃式发展，以成为大兴区最优秀的民办初中校为目标。